使用全基因组测序线粒体疾病的诊断
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文章数据和数据
数据
(C)的深度测序覆盖整个线粒体基因组和(B和D) m。> 3243 G heteroplasmy从2例尸检组织之间的不同,在坚实的组织与血液相当高。彩色的线条在A和C符合颜色的酒吧在B和d颜色模拟与是一致的图1 c为不同的组织。
(一)诊断的数量由WGS核和线粒体基因组,从n = 242名疑似患者线粒体疾病。(B)诊断的频率由线粒体疾病基因在核基因组中。(C) WGS发现一双半合16.4 megabase (Mbp)删除4号染色体上的癫痫患者,轻度ophthalmoparesis,视神经萎缩,小脑性共济失调,肌病,糖尿病,经常性的pseudo-obstruction肠道和肝脏功能障碍。(D) WGS确定纯合946碱基对缺失SPG7在遗传性痉挛性截瘫患者并发小脑性共济失调,眼肌麻痹,感觉神经病变。太=线粒体;WGS =全基因组测序。
(一)诱发mtDNA变异的数量被WGS heteroplasmy和(B)相应的变体。(C)中确定两个线粒体DNA单删除血液,在heteroplasmy低于1%。一个线粒体删除在尸检发现肌肉heteroplasmy更高为15.7%,(D)详细所示,凸显了测序覆盖和读取生成删除。mtDNA =线粒体DNA;WGS =全基因组测序。
患者分为6临床表型(MIDD CPEO,类似中风发作,视神经萎缩,复杂的,和oligosymptomatic)强调致病性核基因和线粒体DNA变异的频率被WGS。精确的分子诊断显示,未确诊的病例数在每个子群灰色所示。CPEO =慢性进行性外部眼肌麻痹;MD =线粒体疾病;MIDD =母体遗传来的耳聋和糖尿病;WGS =全基因组测序。
(A)代表轴T1加权图像显示异常的病灶部位信号强度对parieto-occipital地区集后病人E19脑病。注意也有小整个皮层下白质高信号强度分布。(B)红色箭头表示高信号区病人B54的花托,符合什么是出现在成人利综合症。
表
信:快速的网络通信
-
作者回复:使用全基因组测序线粒体疾病的诊断
- 瑞安L戴维斯,研究员,悉尼大学
- 基肖尔R库马尔,神经学家,悉尼大学
- 埃路易斯沃森,神经学家,悉尼大学
- 卡洛琳米苏,神经学家,悉尼大学
2022年7月27日,提交 -
读者反应:使用全基因组测序线粒体疾病的诊断
- 凯瑟琳·R肖恩,临床研究员,剑桥大学
- 帕特里克·FChinnery,神经学家,剑桥大学
2022年7月14日提交
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