NeuroInterp:促进神经成像研究脑型疟疾的方法
放射数据越来越重要在神经系统疾病的临床护理指南和临床试验的开展评估新的治疗方法。neuroradiologic评估的基础设施和专业知识仍然稀缺在资源有限的环境中,但可用,MRI和CT能力可以提供新的见解普遍,全球毁灭性的疾病。体内的数据经常致命的脑型疟疾等热带条件在很大程度上局限于解剖研究,只提供nonsurvivors信息在一个时间点。新的成像设备在撒哈拉以南非洲地区提供机会扩大研究热带神经紊乱。1然而,数据管理挑战阻碍了研究放射的效用评估。
从neuroradiologic捕捉影像学数据评估的传统方法提供临床目的依赖非结构化叙事描述。故事不适合研究分析有几个原因:不结构化的文本数据统计分析;很少标准化在放射科医生或机构报告;确定一个未提到的特性是否缺失或无意中忽视叙事常常是不可能的;寻找明确的词在文本报告开发一个数据库(例如,肿胀和水肿)是偶然的;与许多physician-driven技术,临床解释可能有相当大的国际米兰,intrareader可变性。
改善效用的磁共振成像在脑型疟疾的临床研究,我们设计了一个数据输入应用程序和工作流工具,NeuroInterp。作为一个乐器,NeuroInterp提示放射科医生从他们的评估系统地收集数据。作为工作流工具,NeuroInterp确保串行数据由多个读者不和谐的数据识别和评估裁定解决。这个方法学开发数据管理方法工具MRI数据也可以应用于其他热带条件的影像学特征明显没有相关。
NeuroInterp仪器。
NeuroInterp仪器的发展始于2008年,当长期结果的一部分小儿脑型疟疾的研究中,大脑MRI收购成为昏迷患者的标准评估的一部分承认伊丽莎白女王中央医院的儿科研究病房布兰太尔,马拉维。1
CT和尸检脑型疟疾的研究提出一些可能射线的发现,包括急性水肿、慢性萎缩,炎性损伤和缺血。2,3开发适当的项目列入NeuroInterp小儿脑型疟疾的平台发现,2年基于叙述结果总结和提炼成离散项结构化的条目。两个训练放射科医生,一个在神经放射学(M.J.P.)和核磁共振(S.D.K.),阅读所有的研究。放射科医生回顾了所有的核磁共振成像研究病房和合作开发了一个系统的评分过程潜在的脑型疟疾病例,包括分级措施脑水肿、室周的白质变化,皮质异常,和脑干的变化等等。4这些包括变量表示解剖定位和描述特定的核磁共振脉冲序列特征,如存在与否的T2异常和/或diffusion-weighted成像的变化。每个特性的变量,允许创建明确的和相互排斥的选项(例如,“有T2信号异常呈现在幕上的皮质内吗?(是/否)”)。模棱两可的话“不适用”的选项还包括对于大多数功能。一些功能无法支持与信心。解决这一矛盾,我们包含一个字段来捕获评论家信心存在与否的功能问题(< 25%,25% -50%,50% -75%,> 75%)。字段也创建捕获临床特征的变化在串行数据在同一病人。字段获取纵向数据得到以下答案选项:进展,保持不变,或退化。重要的是,这是一个迭代的过程,新的见解相关结果导致额外的项目列入NeuroInterp和/或进一步描述现有的变量直到项目饱和没有经常发现额外的新发现。
NeuroInterp应用程序。
开始数据输入应用程序中,我们生成的元数据描述的每个字段所需的工具。元数据作为一组包含的标题或描述、字段或变量名称,数据类型(数字或文本),答案选项(例如,1 = yes;2 = no)。NeuroInterp的数据输入表单是建立在一个专有研究信息管理系统称为一种音乐形式。这个平台生成超文本标记语言(类似于Web页面)形式基于元数据与字段所需的工具。每个数据条目形式致力于一个放射科医生的评估一个neuroradiologic解释为一个病人。元数据可以用来生成形式捕捉结构化数据引导的乐器。
NeuroInterp工作流。
开始工作流,放射科医生组装研究文件,启动NeuroInterp形式,找到或创建一个病人,检查文件,并输入他们的发现提示的形式,讲述了仪器模式。定期评审放射科医师意见的报告显示病人有2阅读和等待不调和检查(见图1和图2)。从这份报告,病人选择和评审官(或个人)合作让每个不整合的最终答案判断字段。
为审判不调和算法识别用例开发比较认可值从2读者和识别不整合值。当一个字段相同的每个字段的值,这个值是自动最终答案。字段,捕捉一个明确支持一个特定功能的存在与否,允许读者之间没有冲突。字段,捕捉读者的信心有更大的容忍不整合在一个明确的认可。为这些字段,工作流允许“糟糕”值作为自动最终答案。字段,捕捉连续体积等措施也有更高的容忍不调和。为这些字段之间的平均值2认可的答案变成了自动最终答案,除非值超过接受变化,因此指出是不和谐的。当检测到冲突回答字段之间没有或有限的宽容,评选用户必须选择一个最终答案在审查neuroradiologic图片/文件/研究。开放式文本字段需要审查的读者评价进入最终裁决的答案。
NeuroInterp-The最终产品。
NeuroInterp仪器指导结构化的评估了神经结构的定量评估。NeuroInterp应用程序有一个基于web的数据输入表单提供数据验证条目和工作流之前确保每个neuroradiologic研究评估两次应用问题特定的不调和算法和裁定效用的差异。NeuroInterp被用来收集数据从338年裁定患者所需的大约15%的变量,在大多数情况下异议相关分歧变量详细程度的异常或参与。
迄今为止,NeuroInterp推动了放射的系统研究发现脑型疟疾幸存者的神经后遗症5以及规范性的研究大脑核磁共振发现社区代表样本的马拉维儿童。6NeuroInterp提供了一个可行的方法来放射数据采集和管理的挑战,特别是对于条件之前描述性数据。我们目前加强NeuroInterp进一步教学图片,便于读者培训和改善interreader可靠性。计划也正在努力从适当软件开源软件,应该允许更广泛使用这个脑型疟疾成像研究的数据管理工具。
作者的贡献
迈克尔·j·Potchen:概念化NeuroInterp程序和早期的原型,开发了初稿的手稿,评估和后续版本,编辑和批准提交的版本。萨姆·d·Kampondeni:在早期的原型NeuroInterp并提供反馈意见的实质性的早期发展,提供了重要的知识评论和早期版本的手稿,编辑和批准提交的版本。哈立德易卜拉欣:技术和后勤支持NeuroInterp并提供反馈意见的实质性的全面发展早期的发展,提供了重要的评论和编辑早期版本的手稿,并批准提交的版本。约瑟夫·邦纳:全面发展的技术和后勤支持NeuroInterp并提供反馈意见的实质性的早期发展,回顾和早期版本的手稿,编辑和批准提交的版本。卡尔·b·Seydel和Terrie e·泰勒:协助定期评估所需的数据从NeuroInterp产品被开发并提供反馈意见的实质性的早期发展,回顾和早期版本的手稿,编辑和批准提交的版本。格雷琴·l·Birbeck:概念化NeuroInterp程序和早期的原型,开发了初稿的手稿,评估和后续版本,编辑和批准提交的版本。
研究资金
早期的原型NeuroInterp支持通过CDFP格兰特在密歇根州立大学(09 - CDFP - 1771)。NeuroInterp的明确的发展得到了奖项数量R21NS069228 Fogarty国际中心和国家神经疾病和中风研究所。内容是完全的责任作者,不一定代表美国国立卫生研究院的官方观点。
信息披露
M.J. Potchen获得研究资金来自美国国立卫生研究院和Dana基金会。k·易卜拉欣,j . Kampondeni,时任美国邦纳收到了美国国立卫生研究院的资助。K.B. Seydel获得研究资金来自美国国立卫生研究院和Dana基金会。式样泰勒已经收到了来自美国国立卫生研究院研究经费。基准线Birbeck获得研究资金来自美国国立卫生研究院和Dana基金会。去首页Neurology.org为充分披露。
脚注
去首页Neurology.org为充分披露。资金信息和披露认为作者相关的,如果有的话,年底提供这篇文章。
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